Cheque pode transformar em duplicata

Bom tarde, gostaria de saber se uma empresa pode protesta no cartório uns cheques no lugar de duplicata, ou seja, pegar o valor do cheque que a pessoa deve e transformar ela em duplicada e protestar no cartório. Porque eu devo na empresa somente cheques e o mês passado descobri que no cartório havia uma restrição e quando puxei a certidão positiva consta somente uma duplicata no valor mais ou menos de R$ 8.200,00, sendo que eu só devo nesta empresa cheques. A empresa pode fazer isso. Deste já agradeço a sua atenção e fico aguardando uma resposta