Cortaram 30 dias de férias que eu tinha direito.

Fiquei afastado pelo INSS por cerca de um ano e dois meses, na ultima perícia foi agendada para 20 dias após o término do meu afastamento, segundo o médico no dia da perícia me deu alta, finalizando, do término de meu afastamento até o dia da perícia contou-se 20 dias que não recebi nem pelo INSS e nem pela Prefeitura onde trabalho, até aí tudo bem, mas a Prefeitura me cortou uma férias que eu já tinha direito, por esses 20 dias de falta (lembrando que eu tinha atestado médico que eu não poderia voltar ao trabalho), agora pergunto: Mesmo tomando prejuízo de vinte dias que não foram pagos por nenhuma das duas instituições, a Prefeitura pode cortar uma férias de 30 dias (alegando que eu faltei por falta de justificação) do mesmo ano?